電子簽章的應用領域的特點就是有愈加頻繁且龐大數據傳輸的需求，對于這些領域數據交換的安全性、保密性、完整性，電子簽章系統的作用是不言而喻的。電子簽章系統主要運用于 B2B、B2C電子商務安全交易管理、證券、貿易、招投標、電子政務、企業內部辦公等等各種領域的電子簽章。

    電子簽章主要應用領域的幾種基本類型：

B2B電子商務

    電子簽章系統首先應用與電子商務交易，為保證企業之間的交易與支付的的安全性、有效性、保密性等，防范交易欺詐；電子簽章系統開發的安全認證系統可以為企業建立一種信息交換的網上信任機制，解決了在線訂單、數據交換、合同管理等的安全問題。

政府政務處理

    由于政府部門的辦公自動化建設，政府機關之間的電子公文交換和互聯網平臺的文件交換信息化的實施，因為這政府文件的機密性，更加要保證其安全傳輸，電子簽章系統通過電子印章、簽名、數字簽名、數字證書等安全信息技術，保證政府政務信息的完整性與不可篡改性、不可偽造性。

審計辦公應用

    電子簽章系統開發對于審計辦公的實際應用，有很強大的技術支持，在增加了審計機關政務系統辦公所需部分功能，保證能夠滿足審計辦公需求。

政府與企業信息交換

    政府與企業之間存在大量的信息交換，，比如：網上繳費、網上繳稅、行政審批網上申報、網上工商、電子海關等方面。電子簽章系統能夠從簽章的法律效力和信息交換的技術可靠性上保證相互之間信息安全，以提高網上辦公的效率和服務水平

企業辦公

    對于多層級劃分的企業或集團內部，企業總部與分支機構之間、上下級之間信息交換也頻繁發生，比如：財務報表、銷售報表等等，運用電子簽章系統能夠保證網絡信息的安全性，實現企業內部的協同辦公，提高信息處理效率、提高辦公效率。適用于制造業、金融、電信、建筑等各行各業的信息安全交換。

    隨著社會信息化的逐步深入，互聯網通訊技術的發展，各行各業對于信息交換的需求也越來越大，電子簽章系統的應用不僅越來越深入，電子簽章的應用領域也在不斷拓展，為實現現代化安全辦公提供強有力的支持。